En mayo de 1862, Pemberton se alistó como primer teniente en el ejército confederado. Durante cinco años después de la guerra, Pemberton trabajo como socio del Dr. Austin Walker, un médico local. Durante este tiempo, Pemberton invertio todo su dinero en la investigación y el desarrollo de una línea de artículos que incluía perfumes y medicinas botánicas con una gran demanda de remedios caseros y tónicos en los Estados Unidos, especialmente en las grandes ciudades.
En 1869, Pemberton se trasladó a Atlanta para iniciar un negocio propio. Desarrollo y vendio con éxito, una bebida que llamó "vino francés de coca." Sobre la base de un producto similar llamado en Europa "Vin Mariana,". La tónica de Pemberton combinaba vino y el extracto de hojas de coca. El extracto de coca se utilizaba en ese momento en medicamentos.
En 1885 Pemberton desarrolló una bebida sin alcohol y añade el extracto de las nueces de cola, un fuerte estimulante que contiene cafeína, junto con la coca, y que sustituye el vino con el jarabe de azúcar. El 18 de mayo de 1886, Pemberton creo una fórmula final para su nueva bebida.
El 28 de junio de 1887, la patente de la marca Coca-Cola fue concedida. La Farmacia Jacobs, en Atlanta, Georgia, fue el primer lugar donde se vendió la Coca-Cola.
